1991年底，黄冈地委组织部批准，撤销中共黄冈地区公路总段总支委员会，设立中共黄冈地区公路总段党委委员会。

1996年4月，黄冈撤地设市，黄地区公路总段亦更名为黄冈市公路总段。

1998年12月，黄冈市机构编制委员会批复，黄冈市公路总段更名为亚洲365bet日博。并将内部机构设为办公室、政工科、工资福利保险与离退休人员管理科、路政绿化科、养护科、工程科、公路车辆通行费征管科、计划财务科、审计科、机务材料科，并设立工会、监察室。直属事业单位市公路规划勘测设计院、公路车辆通行费东门收费站。局直企业有黄冈市公路工程建设总公司。

1998年12月26日，黄冈市机构编制委员会办公室以黄机编办[1998]45号文批复，同意亚洲365bet日博内设科室为办公室、政工科、计划财务科、审计科、工资福利保险与离退休人员管理科、养护科、工程科（加挂公路建设市场管理办公室的牌子）、路政绿化科、机务材料科、公路车辆通行费征管科（加挂公路车辆通行费征稽所的牌子），纪检、监察机构和工会、共青团组织按有关规定设置。直属事业单位为市公路规划勘测设计院、公路车辆通行费东门收费站。局直企业有黄冈市公路工程建设总公司。

2000年3月2日，黄冈市交通局党组根据中共黄冈市委组织部、黄冈市机构编制委员会办公室黄组函[2000]22号、黄机编办[1996]64号、黄机编办[1999]45号文件精神，以黄交党[2000]28号文件批复，亚洲365bet日博内设机构为10个科室、2个事业单位，即：办公室、政工科、计划财务科、审计科、工资福利保险与离退休人员管理科、养护科、工程科（加挂公路建设市场管理办公室的牌子）、路政绿化科、机务材料科、公路车辆通行费征管科（加挂公路车辆通行费征稽所的牌子）；直属事业单位为公路规划勘测设计院、公路车辆通行费东门收费站；纪检、监察机构和工会、共青团组织按有关规定设置。

2004年8月12日，黄冈市人民政府办公室以黄政办发[2004]90号文件印发《黄冈市市属交通事业单位机构改革方案》。该文件同意将亚洲365bet日博所属的公路车辆通行费东门收费站、公路规划勘测设计院、路桥工程处成建制改为企业。亚洲365bet日博，仍为相当于副县（处）级事业机构。业务范围依据国家有关法律、法规、规章规定，受本级交通行政主管部门委托，负责全市公路规划、建设、养护、路政管理、收费公路管理和公路行业信息管理，指导和管理县级公路段的业务工作。亚洲365bet日博内设办公室、政工科、工程技术科、养护科、财务审计科、通行费征收管理办公室、路政科（加挂“黄冈市路政支队”的牌子）、计划统计科8个科室。

2009年7月9日，黄冈市机关编制委员会以黄机编办[2009]13号文件，核定亚洲365bet日博机关事业编制72名，县市区公路段事业单位人员编制总额2754名。

2009年8月26日，黄冈市机关编制委员会以黄机编办[2009]39号文件，同意设立黄冈市江北公路管理站，为市公路管理局所属相当于科级事业机构，负责江北一级公路养护和车辆通行费征收管理等工作。

2009年8月26日，黄冈市机关编制委员会以黄机编办[2009]40号文件，同意撤销市公路管理局路政科，将路政科加挂的黄冈市路政支队单设，并更名为黄冈市公路路政支队，为亚洲365bet日博所属相当于科级事业机构。

2010年11月9日，黄冈市机关编制委员会以黄机编办[2010]72号文件，同意亚洲365bet日博增设建设规划科、政策法规科，至此，黄冈市公路局内设机构由8个调整到10个。